En el 2019, el Sistema Portuario Nacional de Panamá contó con un movimiento total de 7.3 millones de TEUs, este se caracteriza en su mayoría en carga de trasbordo, representando un 86%, mientras que el 14% se debe a carga local (importación, exportación). Los puertos de mayor movimiento en el Sistema se concentran en las entradas del Pacífico y Atlántico del Canal de Panamá. Estos son cinco: Balboa y PSA Panamá (Pacífico); y Manzanillo International Terminal (MIT), Cristóbal y Colon Container Terminal (Altántico). Para el 2019, el conglomerado del Atlántico ocupó la primera posición del ranking de movimiento de Comisión Económica para América Latina y el Caribe.
En adición, el sistema lo compone un sexto puerto de carga contenerizada, la terminal de Bocas Fruit Company, localizado en el interior del país en la provincia de Bocas del Toro (Almirante), enfocada a la exportación de banano.
El Sistema Portuario Nacional está compuesto por puertos privados y estatales. Los privados se concentran en el movimiento internacional de carga y han sido otorgados por el estado a operadores portuarios a través de concesiones. Los estatales se mantienen bajo la administración de la Autoridad Marítima de Panamá dirigidos principalmente hacia servicios de atraque y cabotaje.
Para mayor información sobre el Sistema Portuario de Panamá y estadísticas sobre movimientos de carga, favor ver: https://amp.gob.pa/estadistica/